2022-03-01から1ヶ月間の記事一覧

samtools faidxについて考えてみた

faidxと言えばsamtoolsに実装されている機能の1つで、FASTAやFASTQファイルのインデックスを作ったり部分配列を取り出したりするときに便利なプログラムです。今回はこれについて理解を深めるため簡単な実験をしてみました。 以下のようなテストデータを用意…

Shinyで96(384)-well plateのインターフェースを作ってみた

(以下の記事はR 3.6.3で試しています。) Rはプロットに関する関数が充実して勘所をつかむと結構いろいろなお絵描きができます。例えば私は以前の記事でこんなアホなことをしています。 menseki.hatenablog.jp そして、学生時代よく実験で使っていた96(384)…