RustからOpenCVのロジックを呼び出す理由は特に無いのですが、Rustが好きなのでやってみました。 参考 https://github.com/twistedfall/opencv-rust https://docs.rs/opencv/latest/opencv/ 事前準備 MacOSでは brew install opencv でOpenCVをインストール…

nginxとShinyProxyを使ってShinyアプリをホストするサーバを構築することがあったのでその作業を忘れないようにメモします。 以下システムのイメージ図です。 環境 Ubuntu 22.04 Docker 24.0.1 nginx 1.18.0 ShinyProxy 3.0.0 NGINXをリバースプロキシとして…

前回ちらっと紹介したReactコンポーネントライブラリreact-well-platesを使ってみました。公式のStorybookが参考になりました。 下準備 まず、create-react-appによるアプリの骨組み作成とnpmによるライブラリのインストールを行います。 npx create-react-a…

menseki.hatenablog.jp この記事を書いたときに96 well plateのインターフェースをjavascriptで書いてみたいと思っていたのですが、なんとなくReactのドキュメント読んで適当に書いてみたら自分でもよくわからないまま、なんか動くものができたので一旦ここ…

多重forが発生するケース 例えば3個のパラメータについて、いくつかのパターンの総組合せを試したいということ があるかと思います。 f <- function(x, y, z) { # x, y, zを使って何かするコード sprintf("x: %d, y: %d, z: %d", x, y, z) } x_list <- c(1, …

rust-script(https://rust-script.org/)を使うとRustのソースコードをスクリプトとして実行できます。Rust 1.54以上が必要です。 今回は公式のマニュアル（上記URL）からいくつか抜粋して説明します。 以下の説明はUNIX系OSで実行することを前提としています…

今回は以下のリポジトリにあるCライブラリを使用してみた記録です。 https://github.com/TravisWheelerLab/AvxWindowFmIndex ライブラリのビルド まずは以下の要領でライブラリのビルド〜インストールを行いました。パス等は各環境で適切な値に変えます。 (M…

編集距離k以内の塩基配列（"ATGC"のみ許可）を深さ優先探索で列挙するRustコードを書いたので備忘録として残しておきます。もうちょっとコードをキレイにしたかったのとテストコードは宿題にします。 use bio::alphabets; #[derive(Clone, Copy)] enum Opera…