Docker

ShinyProxyとnginxで解析用サーバを構築する

nginxとShinyProxyを使ってShinyアプリをホストするサーバを構築することがあったのでその作業を忘れないようにメモします。 以下システムのイメージ図です。 環境 Ubuntu 22.04 Docker 24.0.1 nginx 1.18.0 ShinyProxy 3.0.0 NGINXをリバースプロキシとして…

Organelle_PBAを使ってみた

ちょっと古いですがOrganelle_PBA (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5219736/) というPacBioロングリードシーケンスのオルガネラ用アセンブラを使ってみました。Organelle_PBAはさまざまなアセンブリに関するプログラムを組み合わせて自動的に…

Docker で Shiny Server を立てる

shinyとは、統計言語RでインタラクティブなWebアプリケーションを開発するためのパッケージです。 Shinyアプリを実際に稼働させるとなるといろいろな方法があります。実際にどんな方法があるかはhttps://shiny.rstudio.com/articles/#deploymentを参考にする…